1945年，日本人投降了，南通学院的师生也准备结束漂泊在外的日子，准备迁回南通了。他们先是在南通学院本院成立了还校办事处， （图1）接管了在南通的校舍校具。（图2）可是饱经这个战争的创伤，满目疮痍呀，所以这个回家之路，可没那么顺当啊，先说说在上 海的农科跟纺科。由于校舍不够，1946年秋，只有纺工系两个班，染化系一个班跟农科一年级回到南通上课，其余二、三、四年级学生 ，（图3)还只能仍然在上海临时校舍上课，1947年春，农科农艺系以及纺科二年级学生相继迁回了唐闸上课，农科畜牧系以及纺科三、 四年级学生，还仍然留在上海。到了1948年，由于国共内战，南通局势很是不稳，除了新招的两个班，其余的南通的学生又都迁到了上 海去继续上课，真是折腾呀，1949年8月，南通解放，上海也解放了，农科、纺科几百人才冒着酷暑，通过水陆两路迁回了南通，(图4) 这是师生们从上海迁回南通时在码头上的留影。细细算来，从1938年为了躲避战火迁出，一路颠沛流离，整整12年呀，现在终于回来了 ，不容易呀。所以据当时的纺科学生，(图5)也是张謇的嫡孙张绪武回忆说，当满载着全校师生的大达号轮船驶过巍巍狼山，靠近南通港 时，几乎每个人都是热泪盈眶啊。
接下来再说说医科的回迁之路。我们昨天说了， 1938年8月，南通学院医科与江苏省立医政学院合并，（图6）组建了国立江苏医学院， 后来到了重庆的北碚继续办学。日本人投降以后，国立江苏医学院准备迁回镇江，私立南通学院打报告，要求在原址恢复医科，当时的 国民政府教育部很快就批准了这个报告，于是，远在重庆的原医科的师生们从重庆码头登船，一路顺流而下，看（图7）这就当时他们在 长江轮船上拍的一张照片。那真是朝辞重庆彩云间，千里南通几日还，两岸猿声啼不住，轻舟已过万重山啊。呵呵，是呀，在硝烟弥漫 的战火中飘泊了大半个中国，九死一生，现在终于可以回家了，能不高兴吗。而在南通，为了能够再办好这个医科，原医学专门学校首 任校长张詧的儿子，也是南通学院此时的常务校董张敬礼，（图8）特地从大生纱厂拿出16亿法币，把当时的江北医院买了下来，用于充 实医科，重建附属医院。 这样到1946年，医科就正式恢复并招收新生了。刚才我们说的，这是南通大学历史上的第二次三个科系的合并 过程。真是不容易啊，比第一次的合并要复杂得多了，那后来咋又分开了呢？我们下次再说。